内毒素与外毒素的主要区别有：
1、存在部位不同：外毒素由活的细菌释放至细菌体外；内毒素为细菌细胞壁结构成分，菌体崩解后释出。
2、细菌种类不同：外毒素以革兰氏阳性菌多见 ，革兰氏阴性菌多见； 化学组成为；蛋白质（分子量27，000～900，000）；内毒素为磷脂一多糖一蛋白质复合物（毒性主要为类脂）。
3、稳定性不同：外毒素不稳定，60℃以上能迅速破坏；内毒素耐热，60℃耐受数小时。
4、毒性作用不同：外毒素的毒性强，微量对实验动物有致死作用（以ug计量）。各种外毒素有选择作用，引起特殊病变，不引起宿主发热反应。抑制蛋白质合成，有细胞毒性、神经毒性、紊乱水盐代谢等。
内毒素的毒性稍弱，对实验动物致死作用的量比外毒素为大。各种细菌内素的毒性作用大致相同。引起发热、弥漫性血管内凝血、粒细胞减少血症、施瓦兹曼现象等
5、抗原性不同：外毒素的抗原性强，可刺激机体产生高效价的抗毒素。经甲醛处理，可脱毒成为类毒霉，仍有较强的抗原性，可用于人工自动免疫。内毒素是刺激机体对多糖成分产生抗体，不形成抗毒素，不能经甲醛处理成为类毒素。
参考资料：
