因为大部分乘客提前给救生衣充气了，这就导致他们在机舱里卡着出不来。该任务由Leul Aba上尉和Yonas Mekuria上尉执行。还有10名机组人员。飞机爬到高空后，乘客开始享受飞机。但是，二十多岁的三个年轻人交头接耳，看起来很不一样。突然他们松开安全带，直奔飞机座舱。尚未等待机组人员的回应，三人已经进入驾驶舱。他们中的两个在驾驶舱里拿起了灭火器和消防栓。有人走到副驾驶座位上把副机长赶出去了。如果是在劫机者的要求下飞往澳大利亚，则飞机的燃料将用光。如果飞机坠毁，那是劫机者也不希望看到的机器坠毁的结果。队长竭尽全力向他们解释利害关系。劫机者总是无动于衷。说他们检查了这架飞机上的信息，油就足够了。
但是熟练的机长知道，他这么做的结果只是死胡同。结果，他们沿着非洲海岸线向南飞去。劫机者一见到地面，便立即敦促机长改变路线。否则炸弹会爆炸。威胁使机长飞往科摩罗。机长继续试图说服劫机者说岛上有一个可以停靠的机场。当尝试飞往机场时，驾驶舱发出了警报声，表明飞机燃料不足。在飞机降落之前，飞机消耗了最后一滴燃油并停止了发动机。机长只能使用冲压空气涡轮机来维持飞机的最基本操作。某些液压系统无法在此模式下工作。因此该飞机以每小时超过320公里的速度着陆。
当机长为强迫降落做好充分准备时，可恶的劫机者突然开始殴打机长，并试图接管飞机。在决定性的时刻，机组人员与劫机者扭打。机长正在稳固而强制地着陆。机长提醒大家穿上救生衣，飞机上的乘客都很慌张，急着穿救生衣。但是，许多人认为救生衣可以用作安全气囊，因此他们完全忘记了船长的重复提醒，并且聪明地充满了空气。在飞机的最后一次强制降落中，埃航961每小时以370公里的速度击中水面。此后整架飞机处于剧烈晃动的状态。然后在两次连续的撞击中，整个客机被完全摧毁。当机体与水接触时，发动机会进入大量海水，海水会从发动机和机翼上脱落下来。在短短的几分钟内，身穿救生衣的充气乘客被困在天花板上活活溺亡。
当海水灌入机舱时，它没有沉入水中，而是被困在天花板和水之间，出口被淹没在海中，只有脱掉救生衣可以逃脱。但是这时放弃救生衣并从机舱中逃脱时这等于死亡，因此有125人死亡。几名没有事先给救生衣充气的乘客逃离了破损的机舱。然后拉动设备上的两个红色拉环。这时充满气体的救生衣给了他生存的时间。
