一、如果是单位缴纳公积金扣款日余额不足，可以在后面补交，《住房公积金管理条例》第二十条规定，单位应当按时、足额缴存住房公积金，不得逾期缴存或者少缴。
对缴存住房公积金确有困难的单位，经本单位职工代表大会或者工会讨论通过，并经住房公积金管理中心审核，报住房公积金管理委员会批准后，可以降低缴存比例或者缓缴；待单位经济效益好转后，再提高缴存比例或者补缴缓缴。
二、如果是住房公积金贷款银行扣还月供时个人还款账户中余额不足，则会记录逾期信息在个人征信记录中，没有办法补救，为了防止再次记录逾期，应立即存入足够的月供，待银行再次扣还。
