以南方航空为例，飞机托运宠物办理手续流程如下：
1、旅客托运小动物，必须在定座时提出，至少应在航班起飞时间前72小时提出申请，经南航回复后方可托运；
2、个别小型飞机装载活体小动物行李总数不得超过三件，具体应根据南航机务工程部门给出的相关机型限制条件确定；
3、每名旅客只可托运一只小动物或一对鸟类动物（须符合有关承运人和出入境国家的规定）；每只托运的小动物应单独装入一个笼内；一对小鸟可装入同一个笼内；
4、旅客托运的活体动物笼体包装最大不能超过40x60x100厘米，最小不能小于5x15x20厘米，重量最大不得超过32公斤，应单独装笼；
5、如航班机型的货舱条件不适合运输活体动物，不能接受旅客申请办理小动物运输。地面工作人员在收运前应确认该航班机型是否适合运输小动物；
6、南航暂不接受活体小动物联程运输；
7、旅客携带的小动物必须是健康、无害、干净、无异味的，并且不能携带怀孕的小动物；
8、旅客应在乘机之日离站时间90分钟以前，将活体动物自行运至机场办理托运手续；
9、如旅客托运小动物为犬或猫，旅客须签署小动物运输免责书。
扩展资料
《公共航空运输企业航空安全保卫规则》中规定：
第四十七条 旅客办理乘机手续时，公共航空运输企业及其代理人应当采取措施核对乘机人的身份证件和行李。
第四十八条 公共航空运输企业应当制定程序，核对加入机组人员的身份证件、工作证件和乘机证明文件，确保人证相符。
第四十九条 旅客办理乘机手续时，公共航空运输企业及其代理人应当告知其相关安全保卫规定。
第五十三条 已经安全检查和未经安全检查的人员不得相混或接触。如发生相混或接触，公共航空运输企业应当要求机场管理机构采取以下措施：
（一）对相应隔离区进行清场和检查；
（二）对相应旅客及其手提行李再次进行安全检查；
（三）如果旅客已进入航空器，应当对该航空器客舱实施安保搜查。
第五十六条 对通过安全检查的托运行李，公共航空运输企业应当采取措施或要求机场管理机构采取措施，防止未经授权的人员接触，直至在目的地交还旅客或移交给另一承运人。
参考资料来源：南方航空官网-特殊行李-小动物
