1958年10月27日，南昌市委决定撤消三家店镇，原郊区办事处所辖的青云谱乡和城南乡与原三家店镇合并成立青云谱区。区委办公地址设在南昌市第一粮食加工厂内，区人民委员会办公地址设在关圣庙内。
1959年1月，区委、区人民委员会办公地址迁何家坊94号（现井冈山大道338号）。
1960年初，为加强城市居民工作，根据市委意见，1960年4月，区境三家店人民公社成立，同年5月，京山人民公社成立，同年7月，洪都人民公社成立。
1961年8月，市郊区成立，区境青云谱人民公社划出，归郊区管辖。
1964年11月，青云谱人民公社划归青云谱区管辖，辖区设三家店、洪都、京山3个街道办事处及青云谱公社，有居委会43个，生产大队12个，生产队100个，有耕地48.53公顷，人口53927人。
1966年5月，洪都人民公社改为洪都机械厂家属委员会，隶属洪都机械厂管辖。
1968年6月，三家店人民公社改名为井冈山人民公社，同时成立革命委员会，同年10月，京山人民公社成立革命委员会。
1969年12月，洪都机械厂家属委员会改为洪都人民公社，划归青云谱区管辖，并同时成立洪都人民公社革命委员会。
1971年1月，洪都人民公社革委会撤消，成立洪都机械厂家属委员会，隶属关系由原来区管辖变为洪都机械厂管辖。
1972年3月，市效区恢复，区境青云谱人民公社、青云谱农场划归市郊区管辖。
1976年2月，南昌市革命委员会决定洪都家属委员会改为洪都街道办事处，由青云谱区管辖。
1979年1月，城市人民公社撤消，恢复建立街道办事处，9月新增设徐坊和岱大稿山街道办事处，全区共设有5个街道办事处。
1988年底区辖洪都、三店、岱山、京山、徐坊5个街道办事处，92个居委会1994年8月，青云谱乡前万、石马两个村委会划归区辖，交岱山街办管理。1998年1月5日，青云谱乡和7个村委会及青云谱农场一同划归区管辖。
2000年底区共辖5个街道办事处，101个居委会，1个乡，9个村委会，53个村民小组，1个农场。 青云谱区地处赣抚平原腹地。在东经115°51′15″—115°56′3″、北纬28°36′22″—28°39′32″之间。地势东部和北部平坦开阔，西南端为一小片低矮丘陵，平均海拔高度23米，最高点为岱山，海拔高度54.16米。
与全市两县三区接壤，是南昌市“银三心”繁荣板块之一，如果把南昌县、新建县、东湖区、西湖区、青山湖区连接成一个大圆，则青云谱区为圆心。
全境水系发育，沟渠纵横交错，湖泊陂塘星罗棋布。1958年动工的赣抚平原水利综合开发工程，是具有灌溉、防洪、养鱼以及供工业和居民用水的多功能水利综合工程，区境是主要受益地之一。民谚：“上拦天王渡，下堵将军渡，连收三年谷，狗撑得不吃糯米粥”。促使60年代以来，稻谷连年丰收。其灌溉渠道名为“五赣一分渠”，在区境长约2500米。
抚河，原为区境唯一过境河流。过境河段长约5800米，1958年抚河改道后，象湖连同周边洼地汇成广阔水域，面积达38.5平方公里，区境还有四条溪流，分别称漕溪、万溪、黄溪和梅溪。漕溪自区中部偏东向西北而行，经新溪桥一带注入抚河，因1934年修建新飞机场而逐渐淹没；万溪在万溪村境内；黄溪位于黄溪前魏自然村；梅溪又称“沥水”，位于区境南端，流经石门居梅村朱姑桥而达定山桥、观音桥，形成“五里三桥”的自然景观，俗称“九曲迥还太极水”。历史上这里春夏二季雨水充沛，溪水上涨，渔筏上下，川流不息，船只自梅湖可直达朱姑桥梅村。 雨量充沛。多年平均降水量为1522毫米，其中最大年降水量达2132.1毫米，最小年降水量为1044.2毫米。在每年的降水中，春、夏季雨多，秋冬季雨少。4-9月为汛期，降水肢仿量达1076毫米，占年降水量的71%，尤其在4-6月间常有暴雨，占年降水量的53%，多年平均蒸发量为1268毫历仿纤米，其中7-8月的蒸发量最大，达504.8毫米，占年蒸发量的43%，而1、2月份的蒸发量最小，仅有76.3毫米。
全年平均无霜期280天，最长的达330天，最短的为250天，结冰期为66天。
