1、砧木选择 常用砧木品种为辣椒的野生种，如台湾的PFR-K64、PER-S64、LS279品系，是辣椒嫁接栽培专用砧木。甜椒类可用“土佐绿B”嫁接。有些茄子嫁接用砧木，如超抗托巴姆、红茄、耐病VF也可用于辣椒嫁接栽培。
2、嫁接方式 当砧木具4~5片真叶、茎粗达5mm左右，接穗长到5~6片真叶时，为嫁接适期。嫁接用具主要是刀片和嫁接夹。使用前，将刀片、嫁接夹放入200倍的福尔马林溶液浸泡1~2h进行消毒。嫁接场地的光照要弱，距苗床要近。嫁接苗床在温度较低的冬季或早春，应选用低畦面苗床；高温和多雨季节，选择高畦面苗床。嫁接场地周围洒些水，保持90%以上的空气湿度，气温宜在25~30℃，保持散射光照，嫁接场地应用500倍多菌灵药液，或600倍百菌清药液，对地面、墙面以及空中进行喷雾消毒。用长条凳或平板台作嫁接台。嫁接前一天，用600倍的百菌清或500倍的多菌灵对嫁接用苗均匀喷药，第2天待茎叶上的露水干后再起苗。嫁接前，将真叶处的腋芽打掉。采用靠接、插接等嫁接方法。
（1）插接法 插接一般在播种后20~30d进行，砧木有4~5片真叶时为嫁接适期，辣椒苗应较砧木苗少1~2片叶，苗茎粗比砧木苗茎稍细一些。嫁接时，在砧木的第1或第2片真叶上方横切，除去腋芽，在该处顶端无叶一侧，用与接穗粗细相当的竹签按45~60°角向下斜插，插孔长0.8~1cm，以竹签先端不插破表皮为宜，选用适当的接穗，削成楔形，切口长同砧木析插孔长，插入孔内，随插随排苗浇水，并扣盖拱棚保护。
（2）靠接法 嫁接后接穗的根仍旧保留，与砧木的根一起栽在育苗钵中，嫁接后接穗不易枯死，管理容易，成活率高。每个育苗钵内栽1株砧木苗和1株辣椒苗，高度要接近，相距约1cm远。先在砧木苗茎的第2~3片叶间横切，去掉新叶和生长点，然后从上部第1片真叶下、苗茎无叶片的一侧，由上向下呈40°角斜切1个长1cm的口子，深达苗茎粗的2/3以上。再在接穗无叶片的一侧、第1片真叶下，紧靠子叶，由下向上呈40°角斜切1个1cm的口子，深达茎粗2/3，然后将接穗与砧木在开口入互相插在一起，用嫁接夹将接口处夹住即可。
