起诉书和判决书上是一个意思：“另行立案追究刑事责任”。
"另案处理"（Handled separately；Handling as a separate case ）是一个法律专业名词，准确表述是：“另行立案追究刑事责任”。
最高人民检察院、公安部联合制定下发的《关于规范刑事案件“另案处理”适用的指导意见》第二条规定：
本意见所称另案处理，是指在办理刑事案件过程中，对于涉嫌共同犯罪案件或者与该案件有牵连关系的部分犯罪嫌疑人，由于法律有特殊规定或者案件存在特殊情况等原因，不能或者不宜与其他同案犯罪嫌疑人同案处理，而从案件中分离出来单独或者与其他案件并案处理的情形。
扩展资料：
另案处理的适用领域
“另案处理”适用的条件
被“另案处理”的犯罪嫌疑人不少人都涉嫌“窝案”，只是由于某种原因，而被列入“另案处理”的范畴。
这些原因可能是有的犯罪嫌疑人在逃未归案而无法并案处理，或者可能是在某些刑事案件中，部分犯罪嫌疑人由于年龄、刑事责任能力等方面的原因，不负刑事责任，需要“另案处理”。
“‘另案处理’的存在还和地域管辖、级别管辖、职能管辖有一定关系。”广东外语外贸大学法学院副教授杜晓君举例说，“比方说，某些犯罪嫌疑人，如果在本地、异地均有共同犯罪事实发生，若在异地处理更为合适的，可以列入‘另案处理’。”
作用
“另案处理”的作用评价
对于及时处理案件、杜绝超期羁押、将被告人尽快交付审判、增强打击犯罪的时效性等方面起到了积极的作用。“另案处理”如果依法使用，有利于案件的侦查、起诉、审判，有利于节约司法成本。
问题
“另案处理”成“另案不理”
“另案处理”近因公安部原部长助理郑少东案而备受媒体关注。在《财经》等媒体的报道中，郑少东案中的重要角色、广东地下钱庄洗钱案主犯连卓钊正是以“另案处理“名义，顺利躲过审查和起诉而潜逃香港的。
围绕“另案处理”的一系列问题，半月谈记者调查发现，“另案处理”一旦缺失了监督便容易蜕变成“另案不理”，成为司法腐败下的新黑洞。因此，应针对“另案处理”建立更为完善的监督机制。
频频出现的“另案处理”
2002年，广东省江门市公安部门破获了一起地下钱庄洗钱案。广东省江门市中级法院“（2002）江中法刑经初字第33号”刑事判决书显示，颜锡隆等人因通过地下钱庄洗钱，获判非法经营罪，连卓钊作为钱庄的主要出资人，在该判决书中被标为“另案处理”。
因此，连卓钊并未在广东受到司法审判，不久便潜逃香港。
各地的刑事案件中，犯罪嫌疑人被标为“另案处理”的不在少数。
据南昌市人民检察院2007年“另案处理”专项检察活动统计，2006 年度，南昌市、区两级检察机关受理公安机关移送审查起诉案件中涉及“另案处理”人员的案件共计703件1375人，占全年受案数21%。
参考资料来源：汉川市公安局--关于规范刑事案件“另案处理”适用的指导意见
参考资料来源：百度百科--另案处理
