员工在扣除社保和住房公积金之后，剩余部分应该达到31275元，个人所得税就需要缴纳5000元。
使用个人所得税反推员工工资，那么需要知道个人所得税征收的原则。个人所得税是在员工扣除社保以及住房公积金之后超过3500元部分，按照一定税率进行计算的。而且超出部分也是按照金额进行等级划分 ，不同等级的金额按照不同的税率进行计算。
超过3500元部分个人所得税税率：
1 .不超过1500元的 税率为3% 个税总额为45元
2 .超过1500元至4500元的部分 税率为10% 个税总额为300元
3 .超过4500元至9000元的部分 税率为20% 个税总额为900元
4 .超过9000元至35000元的部分 税率为25% 个税总额为6500元
5 .超过35000元至55000元的部分 税率为30% 个税总额为6000元
6. 超过55000元至80000元的部分 税率为35% 个税总额为8750元
7 .超过80000元的部分 45%
根据税率可以发现在第4等中超过了5000的个人所得税，那么计算其中在这个等级缴纳的个人所得税为：5000-1245=3755。那么这个等级的税率为20%，可推算出此等级的金额为： 3755÷20%=18775元
总工资为：18755+9000+3500=31275元
拓展资料：
个人所得税(personal income tax)是调整征税机关与自然人(居民、非居民人)之间在个人所得税的征纳与管理过程中所发生的社会关系的法律规范的总称。
个人所得税的纳税义务人，既包括居民纳税义务人，也包括非居民纳税义务人。居民纳税义务人负有完全纳税的义务，必须就其来源于中国境内、境外的全部所得缴纳个人所得税;而非居民纳税义务人仅就其来源于中国境内的所得，缴纳个人所得税。
个人所得税是国家对本国公民、居住在本国境内的个人的所得和境外个人来源于本国的所得征收的一种所得税。在有些国家，个人所得税是主体税种，在财政收入中占较大比重，对经济亦有较大影响。
2011年9月1日起，中国内地个税免征额调至3500元。2018年10月，个税起征点拟调至每月5000元。
