西瓜枯萎病在西瓜的全生育期均能发生，但以结瓜期发病最重，发病后全株枯萎绝产。该病的病原菌在土壤中、病残体或种子上越冬，通过家畜消化道仍能保持生活力。病菌通常通过种子、农家肥、灌水或雨水等传播，主要由根部伤口或根毛顶端侵入。
为了防止枯萎病的发生，近些年来河北省乐亭县的瓜农都以根系抗枯萎病菌的葫芦、瓠子、冬瓜、南瓜等做砧木，实行嫁接，也就是把西瓜的根换成抗枯萎病菌的葫芦、瓠子、冬瓜、南瓜的根，收到了立竿见影的效果，实现了西瓜地可以连年重茬种植。但是在实践中，我们发现有的地块虽然也是定植的嫁接苗，可一到结瓜期仍有少数植株感染枯萎病而死秧。原因何在？原来，西瓜蔓在生长伸长过程中，一般要用土团或土块压蔓三次，有的土团、土块被雨淋过后变为一滩泥，当这滩泥压住西瓜蔓的叶腋部位时，西瓜蔓便会从叶腋部位长出侧根，扎进土里，枯萎病菌便从侧根根毛顶部侵入，使植株感病枯萎。
简便有效的防治方法是，用土团或土块压蔓时，要远离蔓的叶腋部位。一旦下雨，土团变成泥，压住叶腋部位时，雨后要把叶腋部位的泥土清理净。
