选地整地
选早晚有斜射光照、土层深厚、排水良好、坡度在20。以内、富含85％腐殖质的壤土或砂壤土地块种植。选好地后，收集树枝杂草、秸秆等物铺在地上点燃熏土，可减少病虫害及杂草，提高土壤肥力。熏后耕翻耙平，作成宽1～1．7m、畦长依地势而定，畦向以东西为好，畦间沟宽33cm，深15cm左右，畦面略呈龟背形高畦。如林间种植，应选择并调节遮荫程度；如与玉米等套作，应调整套种作物的播种期，以保障遮荫效果。缺少自然荫蔽或自然荫蔽度不足的地方，均应架设遮荫棚以满足黄连不同生长期对荫蔽度的要求。同样需选肥沃的砂质壤土，pH7左右。深翻25cm，施腐熟厩肥300～500kg作基肥，整平耙细备用。
繁殖方法
主要采用种子繁殖。选种子以栽后4年所结的种子为佳，称“红山种子”。其次3年所结的种子称当年种子。采种后，以1：5倍半湿砂混合储藏于地窖内，或棚下埋藏。黄连生长周期较长，生长6～8年才能收获，故为了便于管理，一般采用集中育苗、播种后第三年移栽的方法。
1.育苗：
9月下旬至12月上旬或早春2月为播种期，在作好的畦上撒播或条播，再用细碎的畜粪盖种，厚约0．7cm，以木板镇压，畦面覆盖苔藓、草等。翌年2～3月出苗，及时揭去覆盖物，加弓形薄膜罩防雨(晴天需揭掉)。长出第二片真叶时幼苗，株行距2cm*5cm。育苗期必须培土壅根，清除杂草。浇水时忌用皮管，宜用喷雾器，有条件地区可用苔藓铺于畦边或畦面，利于保湿。夏天早晚喷洒，冬天视情况喷洒。4、5、9、10、11月各施稀人粪尿一次，以保壮苗。
2.移栽：
播种后第三年移栽，以4～6月进行为最好。在海拔较低的山区2～3月、9～10月也可进行。挖出小苗，洗根部泥土，剪短须根，当日移栽。栽秧时用栽秧刀或一端削尖的小竹片，在栽秧位置下插1刀开一深孔，将幼苗垂直放入，再在孔边斜插1刀培土，将苗压紧，最后平土扶苗浇足水即成。栽苗要选壮苗，栽的深度以叶片1／2入土为度。株行距15cm*15cm或10cm*10cm。
田间管理
1.补苗：
移栽后1个月，补苗1次，翌春3～4月再普遍查补1次。
2.追肥培土：
黄连有根茎向上生长的特性，追肥应结合培土进行。移栽后2～3天施1次饼肥、化肥、粪水等混合肥，称“刀口肥”每亩1000～2000kg。以后每年春秋各施追肥1次。移栽2年以后，每亩加施过磷酸钙25kg。花期用3％过磷酸钙溶液喷于叶面作根外追肥，每年花期前后喷2次。
3.遮荫：
黄连随不同生长年限对荫蔽度的要求，注意遮荫情况，苗的初期需较大的遮荫度，随着苗龄增长对光有一定要求，以散射光为好。随时按情况需要进行补充遮荫措施或减少遮荫物。至5龄需亮棚(强疏林)，增加光照，使根茎生长充分。
4.防治病虫害
a.白粉病：
又名“冬瓜粉”，病原是真菌中一种子囊菌。为害黄连叶片，夏秋季发生，病叶最初见灰白色病斑，上有粉状物，后变成水渍状暗褐色斑，严重时叶片凋枯。
防治方法：冬季清园，将枯枝落叶集中烧毁；发病初期喷洒波美度0．2～0．3度石硫合剂，7～10天1次，连续2～3次。
b.列当：
为寄生性种子植物。寄生于黄连根部，用吸盘吸取黄连植株的营养，严重时使黄连全株死亡。
防治方法：发现后及时连同被寄生植株一起挖掉，烧毁。每年于7月上、中旬列当种子未成熟前清除干净。
c.基腐病：
为害的根茎变褐腐烂，黄连叶柄部分或全部枯死，叶片变黄脱落。
防治方法：用50％退菌特可湿性粉剂每亩lkg消毒土壤；移栽时用65％代森锌可湿性粉剂500倍液泡根10～15分钟，发病前和发病期每半月喷上述药液一次。
选育良种
以移栽后四年所给出的黄连种子为最佳，其次是移栽后3年产的种子。5月上旬前后，当瞢荚果稍呈黄绿色时，及时采收。黄连采种后，以种子5倍量的半湿砂掺拌，贮于地窖或山洞荫凉处埋藏，待播。不可干燥贮存。
【收获加工】
黄连移栽后第5或第6年的10～11月收获。先挖出根部，剪去叶和须根，即得鲜根茎，俗称“毛团”。将毛团运回，不可水洗，直接放烘炕烘干。烘时温度不宜过高，要勤翻动，待干至易折断时，趁热放到槽笼里撞，除去残留泥砂、叶柄和须根，即得商品药材。剪下的须根及叶片单独运回，干燥后可供药用。撞笼里撞掉的须根及叶柄，除净泥砂后可作兽药。一般3～4kg能干lkg商品。亩产干货平均在10Okg左右，产区最高丰产纪录为350kg。
黄连以条粗壮、质坚实、断面红黄色者为佳。
