原因如下：
1.商家在设置可以使用花呗支付服务的时候，是需要支付一些费用给平台，也就是所谓的手续费，一般当买家使用了花呗支付时，卖家要支付订单的0.8％-1%的手续费，虽然支付的金额不多，但对于小本经营的商店来说，积少成多，营业利润也是多少会减少，因此他们是不想做设置花呗支付这样的动作的，也觉得没有必要。
2.商家所卖的商品不能是虚拟商品，如游戏充值、手机号码等，或黄金珠宝等具有投资理财属性的 类目达不到开通花呗所需的要求。
3.商品无分阶段付款，不是系统判断的非正常交易。
4.系统会自动对卖家店铺的状态、开店时长、信用记录、处罚记录、等级、主营类目等综合评估，全都达到了要求才可以开通。而对于线下实体店来说，还需要提交店面照片和营业执照。
5.最后，其实还是主观原因，毕竟蚂蚁花呗这一功能是近几年才出现的特别的消费方式，很多商家不理解并且不信任这种消费方式，甚至还有一些比较老的店铺是连支付二维码都没有的，对于只支持用现金的店铺，这样特别的消费方式他们是更不知道了。
扩展资料：
花呗是互联网时代的依托于场景的信用消费工具，用户在消费时，可以使用花呗的额度，享受“先消费，后付款”的购物体验。 简单的说就是类似于信用卡一样的归于支付宝之内的信贷产品。
蚂蚁花呗已经走出阿里系电商平台，共接入了40多家外部消费平台：大部分电商购物平台，比如亚马逊、苏宁等；本地生活服务类网站，比如口碑、美团、大众点评等；主流3C类官方商城，比如乐视、海尔、小米、OPPO等官方商城；以及海外购物的部分网站。
产品特点：当月买，下月再还款 （淘宝天猫交易时除部分淘宝旅行、充值、电影票等特定类目外为确认收货后下月还款，其他平台交易时下单付款后下月还款）; 免费使用消费额度购物（若使用花呗分期购，买家需按商家设定的费率，承担指定费用）;还款方便，支持支付宝自动还款。
参考资料：百度百科-花呗
