细菌形态与结构的检查法主要包括：显微镜及染色法。
一、显微镜
细菌形体微小，肉眼不能直接看到，必须借助显微镜放大后才能看到。显微镜包括普通光学显微镜、电子显微镜、暗视野显微镜、相差显微镜、荧光显微镜和共聚焦显微镜等，适用于观察不同情况下的细菌形态或结构。
二、染色法
细菌体小半透明，经染色后才能观察较清楚。
染色法有多种，最常用的分类鉴别染色法是革兰染色法。
革兰染色法：
1.方法是固定的细菌标本先用碱性染料结晶紫初染，再加碘液媒染，使之生成结晶紫-碘复合物；此时不同细菌均被染成深紫色。然后用95%乙醇处理，最后用稀释复红或沙黄复染。
2.结果判断可将细菌分为两大类：不被乙醇脱色仍保留紫色者为革兰阳性菌，被乙醇脱色后复染成红色者为革兰阴性菌。
3.医学意义：①鉴别细菌：通过革兰染色将所有细菌分为G+菌和G-菌两大类，可初步识别细菌，缩小范围，有助于进一步鉴定。②选择药物参考：G+菌与G-菌医`学对一些抗生素(antibiotic)表现出不同的敏感性。③与致病性有关：大多G+菌的致病物质是外毒素，而G-菌大多能产生内毒素，两种致病作用不同。
