制度建设是体制创新的集中体现和最终成果。十七届三中全会《决定》指出：大力推进改革创新，加强农村制度建设。《决定》从稳定和完善农村基本经营制度、健全严格规范的农村土地管理制度、完善农业支持保护制度、建立现代农村金融制度、建立促进城乡经济社会发展一体化制度、健全农村民主管理制度等六方面提出了改革创新和规范完善的新举措。农村体制改革的突破，将进一步激发农村发展活力，优化农村发展外部环境，为今后农村改革，推进新农村建设深入发展提供制度保障。
一、稳定和完善农村基本经营制度
《决定》指出：以家庭承包经营为基础、统分结合的双层经营体制，是适应社会主义市场经济体制、符合农业生产特点的农村基本经营制度，是党的农村政策的基石，必须毫不动摇地坚持。稳定和完善农村基本经营制度，《决定》指出：赋予农民更加充分而有保障的土地承包经营权，现有土地承包关系要保持稳定并长久不变。这是全会的一大亮点，意味着农民的土地承包经营关系在现有基础上还将保持更长久，将有利于农村经济社会长期稳定，为进一步完善农村基本经营制度留下了更大的探索空间。农业经营体制机制创新，加快农业经营方式转变，《决定》指出：家庭经营要向采用先进科技和生产手段的方向转变，增加技术、资本等生产要素投入，着力提高集约化水平；统一经营要向发展农户联合与合作，形成多元化、多层次、多形式经营服务体系的方向转变。这一规定为发展现代农业，推进新农村建设提供了政策导向。
二、健全严格规范的农村土地管理制度
《决定》指出：土地制度是农村的基础制度。为保持十八亿亩耕地红线不突破，保证国家粮食安全，切实加强农业基础地位不动摇，《决定》规定了最要格的耕地保护制度的底线。即“划定永久基本农田，建立保护补偿机制，确保基本农田总量不减少、用途不改变、质量有提高。”并提出进一步“完善土地承包经营权权能，依法保障农民对承包土地的占有、使用、收益等权利”。既保护了农民的经营权，又确保十八亿亩耕地的红线不突破有了严格的制度底线。规范土地管理制度，农民土地经营权的流转有了合法化的界定：建立健全土地承包经营权流转市场，按照依法自愿有偿原则，允许农民以转包、出租、互换、转让、股份合作等形式流转土地承包经营权，发展多种形式的适度规模经营。有条件的地方可以发展专业大户、家庭农场、农民专业合作社等规模经营主体。这为土地经营权流转提供了更宽广的探索空间。《决定》对土地的使用和收益作了限定，即“不得改变土地集体所有性质，不得改变土地用途，不得损害农民土地承包权益。”既保护了农民土地承包经营权，又有利于土地适度规模化经营的有序和渐进式发展，也遏制了非法进行土地流转的势头，规范了农地征用、征收行为。
三、完善农业支持保护制度
“完善农业支持保护制度”意味着我国将从农业投入、农业补贴、农产品价格等多方面完善相关政策，不断强化对农业这一国民经济基础和战略产业的支持和保护。《决定》提出了“三个大幅度”的要求：大幅度增加国家对农村基础设施建设和社会事业发展的投入，大幅度提高政府土地出让收益、耕地占用税新增收入用于农业的比例，大幅度增加对中西部地区农村公益性建设项目的投入。《决定》指出了我国“三农”问题的重点：农业基础仍然薄弱，最需要加强；农村发展仍然滞后，最需要扶持；农民增收仍然困难，最需要加快。三个大幅度的投入机制的形成，为“三农”重点问题的解决提供了机制保障。
四、建立现代农村金融制度
《决定》指出：农村金融是现代农村经济的核心。这一制度建设意在为农村发展提供充足的资金支持。《决定》突出两方面的特点：一是政策方面，加大农村金融政策支持力度，拓宽融资渠道，综合运用财政杠杆和货币政策工具，定向实行税收减免和费用补贴，引导更多信贷资金和社会资金投向农村。并鼓励各类金融机构都要积极支持农村改革发展，以确保农村改革进程中的资金充足。二是金融准入制度方面有了新的制度设计。《决定》指出：放宽农村金融准入制度。指出将在加强监管和加快农村信用体系建设前提下“规范发展多种形式的地区中小银行，大力发展小额贷款，鼓励发展适合农村特点和需要的各种微型金融服务。”并“允许农村小型金融组织从金融机构融入资金，允许有条件的农民专业合作社发展信用合作。”同时强调“规范和引导民间借贷健康发展。”这一系列的金融准入政策将加大改善农村改革发展的资金需求，并拓宽融资渠道，将引导各种金融机构及全社会的金融服务广泛地参与到农村改革发展中来。
五、建立促进城乡经济社会发展一体化制度
“建立促进城乡经济社会发展一体化制度”旨在从根本上破除导致城乡二元结构的制度基础。《决定》关于这一制度建设的最大意义就在于给农民应有的平等发展机会，从而实现城乡发展资源和发展机会上的“均等化”。要加快形成城乡统筹发展的体制机制，特别是尽快在城乡建设规划、产业布局、基础设施建设、公共服务、劳动就业一体化等方面取得突破。促进公共资源在城乡之间均衡配置，生产要素在城乡之间自由流动；促进城乡经济社会发展融合、良性互动，必须坚持“工业反哺农业，城市支持农村和多予少取”的方针，逐步破除城乡二元结构体制的制约，形成城乡经济社会发展一体化新格局。《决定》指出重点做好五个统筹。即:统筹土地利用和城乡规划；统筹城乡产业发展；统筹城乡基础设施建设和公共服务；统筹城乡劳动就业；统筹城乡社会管理。特别是对保护农民工权益、促进县域经济发展提出了新的政策要求。《决定》提出：逐步实现农民工劳动报酬、子女就学、公共卫生、住房租购等与城镇居民享有同等待遇。并推进户籍制度改革,放宽中小城市落户条件,使在城镇稳定就业和居住的农民有序转变为城镇居民。在促进县域经济发展方面,《决定》强调：扩大县域发展自主权,增加对县的一般性转移支付、促进财力与事权相匹配。推进省直接管理县(市)财政体制改革,优先将农业大县纳入改革范围。
六、健全农村民主管理制度
“健全农村民主管理制度”,根本目的在于加强村民自治机制建设,不断发展农村基层民主。《决定》中“扩大有序参与、推进信息公开、健全议事协商、强化权力监督”被明确列为当前发展农村基层民主的重点。“扩大有序参与”，涉及到“逐步实行城乡按相同人口比例选举人大代表，扩大农民在县乡人大代表中的比例，密切人大代表同农民的联系”、“深入开展以直接选举、公正有序为基本要求的民主选举实践”等内容。“推进信息公开”涉及村一级的村务公开、财务公开和乡镇政务公开等内容，也体现了与《政府信息公开条例》的对接。“健全议事协商”涉及“完善与农民政治参与积极性不断提高相适应的乡镇治理机制”等关键性改革内容，有望将农民的民主协商层面提至乡镇一级，依法保障农民参与权、表达权、监督权。“强化权力监督”涉及深入开展“以村务公开、财务监督、群众评议为主要内容的民主监督实践”等内容。中国农村民主制度设计开始全面升级。
经过30年的不断探索，我国农村改革发展已进入依靠制度创新的新阶段。把制度建设作为推进新一轮农村改革发展的重要抓手并作出全面安排，必将从根本上优化我国农村改革发展的制度环境，为当前和今后一段时期推进农村改革发展提供坚实的制度保障。
