1、含金量不同
虽然同样是经过全国统一考试，能在全国范围内通用的资格证书，但是执业医师资格的含金量明显是要高于执业助理医师。
以卫生资格职称为例，考取卫生资格中级职称必须要先考执业医师资格。
2、处方权不同
执业助理医师没有处方权，执业助理医师资只能被聘为医士，要在医师的指导下才能进行处方。执业医师具有处方权。
3、报考门槛不同
报考执业医师资格，必须具备高等学校医学专业本科及以上学历，且在执业医师指导下，在医疗、预防、保健机构中试用（或实习）期满一年。
报考执业助理医师的条件低于执业医师，具有高等学校医学专科学历或者中等专业学校医学专业学历，在执业医师指导下，在医疗、预防、保健机构中试用期满一年的，可以参加执业助理医师资格考试。
4、 考试难度
执业医师和执业助理医师资格考试难度不同，执业助理医师的考试难度低于执业医师。
5、 享有权利不同
拥有医师资格，是医生独立开办医院、诊所的必要条件，执业助理医师则无法享有此项权利。《医师执业注册管理办法》中规定，执业医师拥有申请异地、跨省执业的资格，但是执业助理医师只能在县级行政区域内执业。
参考资料来源：百度百科-执业医师
参考资料来源：百度百科-执业助理医师
