巴西龟的公母分辨主要有以下三点：
1、前爪：公的长，母的短。
2、尾巴：公的粗长，母的短。
3、泄殖孔：公的在肛盾外侧，母的在肛盾内侧。
幼年巴西龟公母的分辨
对于常见的龟，无论水龟还是陆龟，对于其幼年龟，从体形上通常可以通过以下性别特征来鉴定其性别：
1）雌性龟：背甲较短且宽，腹甲平坦中央无凹陷，尾细且短，尾基部细，泄殖孔距腹甲后缘较近，腹甲的2块肛盾形成的缺刻较浅，缺刻角度较大；
2）雄性龟：背甲较长且窄，腹甲中央略微向内陷，尾粗且长，尾基部粗，泄殖孔距腹甲后缘较远，腹甲的2块肛盾形成的缺刻较深，缺刻角度较小。
成年巴西龟公母的分辨
对于大多数种类的同年的成年龟，雄龟体形较薄而小；雌龟体形圆厚且大。而具体的性别辨别方法为：
1）排泄孔位置及形状可分辨出雌雄： 公龟的位置接近尾端，孔形长形。 母龟的位置接近腹甲，孔形圆形；
2）尾部的粗细大小，公龟尾较粗大，母龟较细短；
3）甲是否凹陷，公龟有明显的凹陷， 母龟平坦；
4）注意雄性乌龟成熟后全身变成黑色，而雌性乌龟则还是原来棕褐色体色；
5）雄龟腹部的花纹稀疏，而雌龟腹部的花纹密集；
6）雄性个体重不超过500克，四肢的爪较长，雌性个体重达可达1000～2000克，但其指甲会较公龟来的短。
