5个县1个区。截至2019年4月，河源市管辖源城区、东源县、龙川县、紫金县、连平县、和平县共五县一区。全市现设有99个乡镇，4个街道办事处，1251个村委会和155个社区居委会。
1、源城区
位于广东省东北部，河源市的最南端。以老城区为中心，东临河源市紫金县，南临惠州市区惠城区，西临惠州龙门县，北临河源市龙川县、和平县。总面积361.5平方公里。截至2019年4月，源城区辖5个街道：上城街道、东埔街道、新江街道、源西街道、高埔岗街道；2个镇：源南镇、埔前镇。
2、和平县
位于广东省东北部，东江上游，粤赣边境的九连山地区。东连龙川县，南邻东源县，西毗连平县，北与江西省定南县、龙南县接壤。总面积2286平方公里。截至2012年末，和平县辖17个镇，管理25个居民委员会，216个村民委员会；下设160个居民小组、3804个村民小组。县人民政府驻阳明镇解放路。
3、紫金县
位于广东省东中部、河源市东南部、东江中游东岸。东接五华县，东南与陆河县相连、与海丰县毗邻，南与惠东县相邻，西南与惠城区相接，西与博罗县隔东江相邻，西北与源城区相接，北与东源县交界。截至2019年4月，紫金县全县设18个镇、273个村委会26个社区居委会。全县总面积3627平方公里。
4、龙川县
位于广东省东北部，东江和韩江上游东连兴宁、五华，南邻河源，西接和平，北界江西定南、寻乌。全县总面积3089余平方公里。
截至2005年12月31日，龙川县辖25个镇（老隆、四都、黄石、细坳、车田、贝岭、黎咀、上坪、丰稔、赤光、龙母、回龙、田心、铁场、登云、通衢、鹤市、黄布、紫市、佗城、岩镇、新田、附城、义都、麻布岗）。
5、东源县
地处广东省中部，东邻龙川县、梅州市五华县，北接和平县、连平县，南靠河源市区和紫金县，西连惠州市龙门县、韶关市新丰县，是珠江三角洲与粤北山区的结合部，东西长130公里，南北宽66.6公里，面积4070平方公里。
截至2005年12月31日，东源县辖20个镇（仙塘镇、灯塔镇、骆湖镇、船塘镇、顺天镇、上莞镇、曾田镇、柳城镇、义合镇、蓝口镇、黄田镇、叶潭镇、黄村镇、康禾镇、锡场镇、新港镇、双江镇、涧头镇、半江镇、新回龙镇）、1个民族乡（漳溪畲族乡）。
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