一，三证合一后的发票章怎么办理流程。
三证合一新政策实施后，纳税人要开具发票，需要重刻“发票专用章”。一般纳税人税号进行变更前，应将取得的旧税号的进项发票进行认证。已使用旧税号开具的专用发票，应尽快交由购货方认证；变更税号后取得的旧税号发票，应及时退回销货方作废或申请开具红字发票，然后重新取得18位社会信用代码的发票；并且及时告知各供货方，新的发票专用章上应刻制新使用的18位统一社会信用代码。三证合一后，新的发票专用章上具体的办理流程如下：
第一，对于手写票的纳税人可直接填开发票。
第二，对于使用网络发票系统的纳税人办理三证合一专用章：纳税人首先要将剩余的空白发票在系统里作废，作废后打印出《发票使用情况报告表》，之后带未查验的发票到大厅缴销，同时领取新的授权码，重新安装网络发票系统。
第三，对于防伪税控系统的纳税人办理三证合一专用章，要进行防伪税控系统的注销和重新发行。具体流程如下：
①申报期内报税清卡。若持有空白税控发票，可直接作废，也可做空白发票退回处理。
②持工商营业执照和税控设备，到办税服务厅办理税务登记变更，
③在办税服务厅的“发行岗”领取《注销防伪税控系统申请表》，办理“修改时钟授权”，纳税人持授权后的税控设备回去修改金税时钟为下月1日后，进行当期抄税。
④纳税人持工商营业执照、已当期抄税后的税控设备、打印《开具增值税专用发票汇总表》及《增值税普通发票汇总表》、《注销防伪税控系统申请表》、发票领购簿、作废发票和全部空白发票到办税服务厅“认证报税岗”进行注销报税和空白发票退票手续。同时办理新的税控发行事项。
二，三证合一影响巨大，下面是三证合一后其他注意事项：
第一，纳税人原有的15位税号变为18位统一社会信用代码，纳税人在注销防伪税控系统当月应暂停开具发票。如当月已经开具发票的，应作废冲红后再办理注销；否则等到次月再办理注销。
第二，企业登记机关新设登记、变更登记（备案）后，将其基本登记信息、变更登记（备案）信息即时共享到省级信息共享交换平台。税务机关确认纳税人信息后，将该税务主管机关全称即时共享到交换平台。这样，税务与工商部门共享“一照一码”注册登记信息。
第三，一些涉税信息如税种、票种登记等需要税务机关补录，才能纳税申报和购买发票。
三，一般纳税人在办理“三证合一”时的具体流程：
第一步：先到工商部门办理变更，上缴“三证”，换出“一照一码”，再到开户银行办理变更，最后持相关资料到国税部门办理变更。
第二步：办理国税变更，国税变更建议选择开票和进项业务量少的月份办理。
第三步：防伪税控业务处理，主要是处理好专用发票问题。将收到的进项发票全部认证完毕，将手头结存的专用发票全部开具完，如无法全部开具完，要在该月内作废剩余空白发票、制作核销清单并拿到国税窗口核销。
第四部：变更。纳税人持金税盘到国税大厅窗口进行防伪税控注销旧号码，发行新号码操作。金税盘注销发行成功后，到登记窗口变更税收征管系统的基本信息，重新签订银税协议，并跟踪本月自动扣缴税款是否成功。出口企业还要到出口业务部门办理相关的变更手续。
