商业银行是存款保险的投保主体，《条例》实施对商业银行的影响主要体现在三个方面：
一是对银行财务的直接影响：成本增加，利润减少。对商业银行来说，存款保险制度最直接的影响是因缴纳保费而带来的成本增加，进而影响到盈利。
二是对银行竞争格局的影响：强者恒强，弱者恒弱。从根本上来说，存款保险制度撤掉了原来银行普遍享受的国家隐性信用担保，一家银行能否在竞争中胜出，最主要的决定因素还是银行的服务水平、经营效率、风控技术和盈利能力。
三是银行所受到的来自非银行金融机构的存款分流压力可能会缓解。存款保险制度的推出，会强化存款人的风险意识，互联网金融等非银行金融由于不在存款保险范围，其非保本风险将更加凸显，从而削弱其吸引力，降低其对银行存款的分流压力。
