效能监察工作程序要依据该单位的效能监察管理管理规定确定。
如你单位没有效能监察的管理规定，请参考《中央企业效能监察暂行办法》国资发纪检[2006]139号，该办法较全面地规定了效能监察的工作程序和要求，但是，该办法是面对的普遍现象，其释义有多种解释，也存在执行中的较大差异，一般企业均根据其要求制定符合本企业的效能监察实施（或管理）办法。
目前，符合《中央企业效能监察暂行办法》要求的效能监察组织模式可分为三类，一是监察检举式，即由企业高层设置效能监察组织，全面监察和考核下属各机构及其管理人员的履职能效；二是辅导激励式，由企业高层委派辅导人员，采取激励措施，辅导督促下属机构及其管理人员主动提高履职效能；三是前两者的结合，国企较少见，多见于私企的能效管理。
你可以根据企业的具体情况，选择合适的组织模式，进而设置和规范工作流程。
