（一）从外部矛盾入手，为行政事业单位内部审计创造良好的外部环境。
1.进一步完善内部审计法律法规体系。制定专门的内部审计法律法规，建立健全内部审计职业规范，依据国家审计法律法规和财经法规建立内部审计规章制度，从而实现内部审计工作的法制化；同时，面对内部审计出现的许多新情况、新问题，内部审计法律法规建设必须与时俱进，杜绝理论滞后于实践的现状，从而逐步建立有行政事业单位特色的内部审计法律法规体系。
2.加强与外部审计的协调工作。一是加强内部审计和政府审计工作成果的相互利用。政府审计有着更为专业的人员、更加充沛时间，内部审计要充分借鉴政府审计工作成果，最大限度地减少重复性工作，从而提高审计工作效率。二是内部审计工作可以邀请社会审计力量的参与。邀请社会审计的参与既可以解决内部审计任务重、人手少的矛盾，又有助于提高内审人员的专业水准，提高内部审计工作的独立性，提高工作效率。三是加强与外部审计人员的沟通。包括日常的业务交流、制定审计计划时的协调、具体审计程序和方法上相互沟通，以及必要范围内审计工作底稿的交流等。
（二）以解决内部矛盾为本，规范行政事业单位内部审计，提高审计效率。
1. 从理论层面入手，要不断建立健全单位自身内部审计规章制度。目前形势下，内部审计呈现出动态性和综合性的特点，因此行政事业单位要依据国家相关审计法规和财经法规，结合单位实际加强在内部审计方面的调研工作，加大内部审计理论研究，不断提高内部审计的理论水平，并制定出具有前瞻性、突出专业特点、可操作性强的内部审计规范，促进内部审计工作系统化、科学化、规范化。
2.从认识层面出发，争取领导重视，确保内部审计工作的顺利开展。内部审计工作往往涉及单位的难点和敏感问题，如果没有领导的支持，内部审计人员根本无法放开手脚。因此，必须通过各种途径宣传内审的作用，一方面要引起本单位主要领导的重视，确保内部审计工作能够顺利进行；另一方面要帮助被审单位主观上对内部审计的职能有一个准确的定位，使他们理解内部审计的职业特点、职能作用，从加强管理的需要出发对内部审计有功能性的需求，而不是应付检查。同时，内部审计人员要努力工作凸现内审工作实效，不断促使广大内部审计人员转变观念，不仅要善于发现问题，更要善于提出改进工作的建议，在强化内部管理、提高资金使用效率、规范系统财务运作等方面充分体现内部审计的价值，从客观上促进管理部门对内部审计的重视，为内部审计工作的开展奠定坚实的基础。
3.从技术层面出发，不断提高内审人员综合素质，改进审计方法，提高审计效率。一是不断改进审计方法，即内部审计与外部审计相结合、内部审计与专业审计相结合；二是提高内部审计人员的道德修养、专业技能和协调能力；三是加强对内部审计人员专业技能培训等。
总之，我们必须充分认识到当前积极开展行政事业单位内部审计工作的紧迫性，相信通过行政事业单位的共同努力，内部审计工作一定能够在广大行政事业单位发展过程中发挥出其应有的作用。
