深圳河正源为沙湾河,发源于龙岗区南湾街道牛尾岭,由东北向西南流入深圳湾,全长37公里,河道平均比降1.1%,水系分布呈扇形,主要支流有深圳一侧的布吉河、福田河、皇岗河、新洲河及香港一侧的梧桐河和平原河。流域面积为312.5平方公里,其中深圳一侧为187.5平方公里。
深圳河是一条被订为香港与中国大陆的边界的河流,位于香港北区和广东省深圳市之间,罗湖桥和福田口岸边境大楼等均横跨于深圳河上。事实上,现时的边界除了深圳河外,还有沙头角河和中英街。
深圳河于历史上称为明溪,自1898年《展拓香港界址专条》起,更改称为深圳河,作为英国租借香港新界部份的99年界限时期的界河。深圳河是香港最长的河流。