在实际中两种方法都存在于两个市场中，一个市场中的好方法很快会传播到另一市场，套利交易尤其适合程序化交易，主要是因为电脑比人的动作更快， J。P摩根的执行理事――拉塞尔縠布拉姆森说一些程序化交易软件能在一秒中内传递几千条交易指令到交易所，能不断地根据市场变化取消和替代交易指令，快速准确地扑捉任何价格异动。
当然，任何事情都有两面性，正如操盘手担心交易中被投资银行玩弄一样，投资银行也经常听到他们的客户在交易中被程序化交易者玩弄的抱怨，J。P。摩根的阿布拉姆森说，在过去半年时间里这种抱怨不断增加，他认为这就是程序化交易在期货市场上应用的结果，比如，客户看到报价栏里的价格后马上去下单，但当他们发出指令后这个价格已经不见了。
根据一些参加期货交易信息交流大会的人员透露，一些公司通过同轴光缆将程序化交易系统与交易所联结起来，有时，他们下买单，他们知道这一报价将引发程序化交易者的回应，然后立即取消这一指令并下卖单，这样可能争取到更有利的价格或在同样价格下的较大的成交量。
这种行为在期货市场的历史上并不新鲜。只不过现在的行动更快，但期货业的老前辈们记得在场内交易时同样的作弊行为，当一个有吸引力的报价传到交易池中时，其它的交易员都在观察他们的交易意图，为了掩盖他们的行动，他们可能在交易池的另一边已经将这一报价执行。
然而，程序化交易工具的发展类似于军备竞赛，只要有一种程序化交易系统被广泛使用，一些人就会从这种系统中设计出新的系统，一些生产商说他们现在正在设计第三代程序化交易系统，毫无疑问，这种更新换代将不断持续下去。 。
