吉林省农业科学院（东北创新中心）由长春院区和公主岭院区组成。占地总面积585公顷（长春院区和公主岭院区），其中试验用地400多公顷；总建筑面积约34万平方米。拥有大型仪器设备1500多台件，科技文献收藏量30余万册，各种珍贵档案资料40000卷。收集拥有玉米、水稻、大豆等作物育种资源20000余份。
全院内设12个处室、12个研究机构、1个农业信息服务及技术推广机构，1个农场、2个综合试验站。此外，主管一所大专学校——吉林农业工程职业技术学院，有13个关联企业。其中，院机关和大豆研究中心、生物技术研究中心、农业环境与资源研究中心、农产品加工研究中心、农业经济与信息服务中心5个单位设在长春院区；畜牧科学分院（下设畜牧研究所、草地研究所、动物营养研究所）、玉米研究所、水稻研究所、植物保护研究所、作物育种研究所、果树研究所、经济植物研究所（范家屯）、农村能源研究所10个研究所，良种繁育实验场以及主要试验地在公主岭院区；2个试验站分别是范家屯综合试验站、洮南综合试验站。
全院共设229个学科，其中一级学科54个，二级学科175个。承建国家和省非独立科研机构、基地、中心、实验室37个。
