有几种形式的过滤可以选择，但主要看什么鱼缸以及缸内养什么鱼。
（1）壁挂式瀑布过滤器。成本低，但仅靠一小块过滤棉过滤效果自然是强不了，多见于40CM以下长度的鱼缸用，因为小鱼缸往往没有更好的选择；
（2）壁挂式滤桶。过滤效果比瀑布好多了，但价格已经上来了，40-60厘米的缸往往比价适宜；
（3）小型内置过滤器。一般兼具过滤和增氧两种功能，抽鱼粪便的能力很差，唯一的好处就是不占用鱼缸外部空间。另，有些成品的鱼缸会自带这种过滤；
（4）独立滤桶。过滤效果可以说非常好，一般40CM以上长度的缸就比较好购买到合适型号的滤桶，加CO2的草缸必须用滤桶，否则CO2易逃逸；另外需要说明的是滤桶的强项是过滤的很细，但是养那些能吃能拉的鱼也要用滤桶的话统必须很大（过滤功率不用太大）；
（5）上过滤，有些成品鱼缸采用这种设计，缸内有过滤器和上滤盒。结构简单，过滤效果也比较好，维护起来也方便。控制进水口离缸底的距离在5毫米以内可以较容易的吸起缸底杂物；
（6）多层上过滤，上过滤的增强版，但过滤效果是倍增的，因为多层过滤盒不光可以放过滤棉还可以放滤材培养硝化细菌。缺点是多层过滤盒摆在鱼缸上面，比较影响美观，有时会有头重脚轻的感觉；
（7）侧滤（背滤同理），做侧滤的鱼缸一般不会太小，因为要将鱼缸的一侧隔出一小块区域，再把这块区域细分为沉淀区、净水区等两三个区域，过滤的效果还不错，缺点就是用掉的缸内的空间以及过滤棉必须勤换，否则一旦棉变得不透水就可能造成水泵空转；
（8）底滤，必须是有地柜的鱼缸，一般认为底滤是兼具过滤能力强、易维护和美观等多个优点的。一般养中大型的能吃能拉的鱼底滤绝对是首选，唯一不能采用这种方式的就是加CO2的草缸。
