缴费不同 医保缴费高于农合
医保按照工资的一定比例缴纳，缴费基数是上年度本人的平均月薪，每个地区的缴费比例稍微有点差异；医保是强制缴费，自动扣费。
新型农村合作医疗的缴费标准有每年100元、200元、300元、400元、500元，各个地方根据自身的情况来设置缴费的档次，不同的省市，因为经济水平的不同，缴费标准有所不同；农合是自愿参与、自愿缴费。
报销不同 医保优于农合
职工基本医疗保险参保人拥有个人账户，定期会有费用划入，报销比例较高，有起付标准，限额较高，医疗费不封顶，报销范围较广。
新农合的报销比例不算高，政策范围内门诊和住院费用报销比例提高到了50%和75%左右；报销范围小于医保。
拓展资料：
基本医疗保险就是我们常说的社保里医保,是国家和社会根据一定的法律法规，为向保障范围内的劳动者提供患病时基本医疗需求保障而建立的社会保险制度。
新型农村合作医疗（简称“新农合”）是指由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。其采取个人缴费、集体扶持和政府资助的方式筹集资金。
参考资料：百度百科 医保 百度百科 新型农村合作医疗
