一般来说雄鱼比雌鱼大(这是指同一窝鱼而言),在有些品系中雄鱼的头会较突起,雌鱼的都会比较圆顺,在背鳍和臀鳍上,雄鱼通常会比雌鱼略大一些。色泽条纹上也常会出现差异,例如雌鱼的红色条纹可能会较多,雄鱼会较少,甚至没有条纹,这种表现也反映在红色系七彩神仙身上,正因为如此,红色系的七彩神仙雌鱼一般红的多一点,深浓一点。当然这种辨别不可能百分之百准确。
七彩神仙的雌雄分辨,最准确的方法是从生殖器上判定,雄鱼的输精管较为尖细,雌鱼的产卵管较为圆而粗,但是这些要在发情产卵期才看得清楚。平常的时候,除非经验较丰富,不然也不容易看准。结合各项特征会较为准确辨别。