县委办公室确实是正科级机构，但是办公室主任可以是正科级，也可以是副处级（副县级），而且大多是由副县级领导担任的。
大部分地级市市辖县属于正处级单位，其下辖机构县委办公室矮一级，为正科级单位，所以办公室主任为正科级。县委办公室在县里属于重要部门，办公室主任一般都是县委常委，是副县级也就理所当然了。
扩展资料：
依据《中华人民共和国公务员法》，公务员领导职务层次分为：国家级正职、国家级副职、省部级正职、省部级副职、厅局级正职、厅局级副职、县处级正职、县处级副职、乡科级正职、乡科级副职。
县级以上公务员主管部门负责职务与级别设置、确定工作的组织实施和监督管理。
对不按照规定的职务职数要求、资格条件及程序等设置职务、确定公务员职务与级别的，不予批准或者备案；已经作出的决定一律无效，由公务员主管部门按照管理权限予以纠正。
对违反规定进行公务员职务、级别确定的，应当根据具体情况，依法追究主要责任人以及其他直接责任人的责任。
