两者可以同时服用。
复方鱼腥草颗粒清热解毒，用于外感风热引起的咽喉疼痛、急性咽炎、扁桃体炎，不宜在服药期间同时服用温补性中成药。
抗病毒口服液的主要成分有：扳蓝根、石膏、芦根、生地黄、郁金、知母、石菖蒲、广藿香、连翘。辅料为蜂蜜、蔗糖、羟莘甲腊、羟苯乙脂。为棕红色液体；味辛、微苦。抗病毒口服液具有清热祛湿，凉血解毒的功效。用于风热感冒，流感。
抗病毒口服液是依中医泻火验方中的“白虎汤”和“清瘟败毒饮”为基础改进而成，属清热凉血、泻火救阴、解毒开窍的排毒重剂方剂，因而用于风热感冒、流感。不宜在服药期间同时服用滋补性中药。
由此可见，复方鱼腥草颗粒和抗病毒口服液，两者是同类的药物，相互之间不存在配伍禁忌。在大量的临床观察中，也并未有实验证明抗病毒口服液和复方鱼腥草颗粒有之间有什么不良反应，因此说，是可以同时服用抗病毒口服液和复方鱼腥草颗粒的。
不过，两者药效高度相似，如果病情不那么严重的话，本着节约的原则，只服用一种就可以了。
