可以从以下几个方面着手：1、收入管理。审计时可以看行政事业单位将取得的各种租赁收入、国有资产处置收入、代征代扣手续费或违规收费等收入是否计入“暂存款”科目长期挂账来逃避纳税和监督检查；将应缴预算款或应缴财政专户款长期挂在“暂存款”科目，列收列支，隐瞒应缴财政收入；将专项资金长期挂在“暂存款”科目，造成专项资金被挤占或挪用；有些单位之间为了逃避财政部门监管，直接将支出票据在应支付相关费用的单位报销。以上造成行政事业单位收支核算不实，影响了单位收支规模的真实性。
2、票据管理。可以审查单位票据的领用和核销有没有办理任何手续形成“小金库”。有没有按规定使用财政票据。有没有为了谋取小团体利益，采取开“阴阳票”或自制收据套取现金，逃避财政部门监管，形成“帐外帐”。票据档案保存完不完整，有些单位作废的票据保存不完整，有的收据联未收回，有的只收回了报查联。3、固定资产账实相不相符。有没有按要求设置固定资产账目，账面资产额与实际资产额相不相符，购入固定资产后有没有列入资产账登记核算、基建项目竣工后有没有进行决算审计，长挂往来账，形成了有账无资产或有资产不入账问题；有没有不按资产的增减变化进行会计核算，造成固定资产账目不全、登记不清的问题。以上问题直接影响资产的完整性和实在性，不利于对领导干部任职期间的国有资产保值增值进行客观评价。
4、经费列支有没有超预算、挤占挪用的现象。行政事业单位有没有因预算不够细化和约束力不强，对支出控制不严，出现挤占专项资金，占用代管资金，甚至挪用财政专项资金来弥补经费不足的问题。有的项目资金应该专款专用，资金只能按照财政部门的批复项目内容使用，实际执行中，存在部分单位从中列支正常的办公支出、资金未及时拨付项目单位、挪用项目资金等问题。
5、有没有以招待费会议费等名义虚列支出。审计时查看有没有采用虚开发票的方式以会议费、招待费、维修费等各种名义虚列支出，或在项目支出中大量列支应在基本支出中列支的办公费、公务用车维护费、公务接待费等日常办公费用；有的单位将费用下沉到下属二级单位，规避监督。
