1、细胞壁上的不同
古生菌的细胞壁是由多糖、糖蛋白和蛋白质组成的,最常见的细胞壁类型是类结晶表面层。
真细菌G+的细胞壁主要含有肽聚糖,有的含有磷壁酸；G-含有稀疏的肽聚糖和脂多糖、蛋白和周质。
2、细胞膜上的不同
古生菌：磷脂的疏水尾由异戊二烯重复单位组成，亲水头(甘油)与疏水尾间通过醚键连接，细胞膜的侧链由不同的化合物构成。
细菌和真核生物的脂肪酸没有这些侧分支。
扩展资料:
主要类群
产甲烷和嗜热菌是人们早就熟知的细菌，由于过去人们只注重了它们产甲烷和耐热的特性，一直将其归为真细菌的范畴。
直到20世纪70年代后，由于细胞化学组分分析和分子生物学方法的建立，特别是16S rRNA序列分析方法的不断完善，才对产甲烷细菌、嗜热细菌、嗜盐细菌等极端环境微生物的研究逐步深入。根据16S rRNA序列分析绘制的古生菌系统发育树展示出古生菌各个类群系统进化的关系。
由根部向上可将古生菌分为4个亚群：
第1亚群：近根部的甲烷嗜热菌已经能还原硫的超嗜热古生菌，包括硫还原球菌、硫化叶菌、热变形菌、热网菌、热球菌，它们统称为泉古生菌界，超嗜热菌的寡核苷酸标记是UAACACCAC和CACCACAAG。
第2亚群：产甲烷古生菌，包括产甲烷球菌、产甲烷杆菌、甲烷嗜热菌、古生球菌以及产甲烷八叠球菌—产甲烷螺菌类群。AYUAAG序列是极端嗜热菌的标记。
第3亚群：极端嗜热盐的古生菌独立成群，包括盐杆菌—盐球菌，AAUUAG序列是极端嗜盐菌的标记。
第4亚群：嗜酸、嗜热的热源体也是独立成群的，AAAACUG和ACCCCA寡核苷酸序列是热源体的遗传标记。谱系树中的第2亚群、第3亚群和第4亚群构成了广古生菌。
参考资料来源：百度百科-古生菌
参考资料来源：百度百科-真细菌
