中国科学院沈阳应用生态研究所是 1981 年国务院学位委员会首次批准的博士学位点。截至2014年底，该研究所设有生态学、 农业资源与环境 2 个一级学科博士研究生培养点ꎬ 微生物学、 环境科学 2 个二级学科博士研究生培养点ꎬ生态学、 农业资源与环境 2 个一级学科硕士研究生培养点ꎬ 微生物学、 植物学、 森林培育、 环境科学 4 个专业二级学科硕士研究生培养点ꎬ 并设有生态学、 农业资源与环境 2 个一级学科博士后流动站ꎬ
共有在学研究生 337 人 (其中博士生162 人ꎬ 硕士生 175 人)、 在站博士后 25 人ꎮ
