你好！
上面你所写的三个内容，实际上是两个大类（营业账簿和权力许可证照），注册资本应归于于营业账簿中的资金账簿。
下面简单介绍下：
营业账簿分为：1，资金账簿。2其他营业账簿。
资金账簿就是记载单位“实收资本”和“资本公积”的账簿。
其他营业账簿就是反应除资金资产以为的其他生产经营活动的账簿。
权利，许可证照就很简单了，就像工商营业执照，商标注册证，土地使用证等。
就你这个问题需要区分：
1，要是注册资本一次到位的，就按10万元计征。
公式：资金账簿（上面的注册资本）100000*0.0005=50
其他营业账簿（你写的营业账簿）和权力证照按每本5元计征
2，要是注册资本分次到位时：
公式：资金账簿（上面的注册资本）=到位的资金（实收资本）*0.0005
其他营业账簿（你写的营业账簿）和权力证照按每本5元计征
到下次收到资本时再补交印花税，税额=下次收到的资本金*0.0005
希望上面的回答对你有所帮助！
补充回答：
权利许可证照就是下列5大类：
工商营业执照、房产证、土地使用证，商标注册证，专利证
你上面所说“税务登记证、组织机构代码证、开户许可证”不在列举范围内，不应征税。
关于印花税缴纳方法有两种：
（一）是购买印花税票自行贴票完税。
（二）对于完税金额较大，或者需多次贴票完税的可以申报纳税（就是你所说的直接交税金）。
