工伤住院费用由用工单位或者个人先行垫付。参加了工伤保险的，由工伤保险机构审核报销；没有参加工伤保险的，由用工单位支付。由于工伤治疗限定了药品目录等，超范围用药工伤保险基金不予报销，一般情况下，不能报销的部分都是超范围的用药。但是你只要能证明属于抢救和治疗需要用药，不是本人或者家属自行做主用药，可以由医院出具证明，由工伤保险基金或者用工单位给予报销。
住院治疗剩余六万元，所在单位要求你们个人承担，这是一笔不小的费用，单位要求在评残赔偿所得中扣除，这是不合理的。按照现行的工伤保险条例和规定，单位只能同你们协商进行处理。如果单位要执意扣除，你可以申请劳动仲裁或就行诉讼。
