一、教育方式不同
高等专科比职业技术学院更加重视理论教学，但是和本科教育相比还是有一定的差距。职业技术学院更加注重实践操作和轻理论些，注重应用能力的培养，更加贴合于市场的技术人才需求。
二、学校命名不同。
根据教育部相关规定，师范、医学、公安类的专科层次全日制普通高等学校应规范校名后缀为“高等专科学校”，而非师范、非医学、非公安类的专科层次全日制普通高等学校则应逐步规范校名后缀为"职业技术学院"或“高等职业学院”。
三、类型的区别
职业技术学院是中国高等院校的一级学院，属高职院校范畴，属普通高等学校，等同于高等专科学校，并逐渐开始取代高等专科学校。以高等职业教育为主要内容，在大学录取顺序中为统招专科第一批、专科第二批，也是“三校生”（职业高中、中等专业学校、技工学校）单考单招的录取院校，同时一些本科高校的统招专升本教学工作也安排在某某大学职业技术学院。
