1、工资不同
合同制老师，采用聘用制的用人形式。这些教师的工资，参照在编教师发放。代课教师的工资要远低于非在编教师和合同制教师。
2、招聘考试录用不同
非在编教师和合同制教师都是通过教育局组织的统一教师招聘考试录用的，与教育局签订聘用合同，工资由财政支付。代课教师是由学校自己组织招聘的，工资由学校自己发放。一般情况下，代课教师的工资要远低于非在编教师和合同制教师。
3、工作稳定性
在编教师拥有的编制为事业编，即在编老师为事业单位工作人员。非在编教师即为临聘人员或者称作合同工。合同制教师稳定性也还可以，基本不存在被解聘的风险。代课教师一般不缴纳五险一金，在原有教师回来之后，会面临被解聘的危险。
4、五险一金的区别
代课老师，有的学校，由于教师休产假或其他原因，出现临时性教师短缺，又无法通过教师招聘的方式统一调配，就只好雇佣代课教师。代课教师一般不缴纳五险一金，合同制的老师，有五险一金，五险一金是按企业险缴纳。
参考资料来源：百度百科-教师编制
参考资料来源：百度百科-代课教师
