本质上是没有区别的。
细分区别在于灵活就业人员一般社保中心只缴纳养老保险与医疗保险，而公司缴纳社保为养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险。
自己缴纳社保属于灵活就业人员参保，费用全部由个人承担。在公司交社保属于企业的一种硬性福利，费用由公司和个人共同承担。两者都属于城镇职工社会保险。
社会保险 、是一种为丧失劳动能力、暂时失去劳动岗位或因健康原因造成损失的人口提供收入或补偿的一种社会和经济制度。社会保险计划由政府举办，强制某一群体将其收入的一部分作为社会保险税（费）形成社会保险基金，在满足一定条件的情况下，被保险人可从基金获得固定的收入或损失的补偿，它是一种再分配制度，它的目标是保证物质及劳动力的再生产和社会的稳定。社会保险的主要项目包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险。
