两个字：丢人
日本海军潜艇的运用思路不同于当时的任何一个国家，英美德的等国的潜艇，主要是用于破坏海上交通线，最有名的就是德国潜艇在大西洋的袭击作战了，还有就是用于舰队的反潜，比如美国。苏联的潜艇用于运输。
日本的潜艇运用思路是这样的，由于条约限制，使得日本海军主力舰吨位远少于美国，所以为了应对预想中的舰队决战，日本海军必须要舰队决战的前夜，或是之前几天，运用雷击战和航空战削弱美国海军的主力舰队，这就是著名的渐减邀击作战，或者说是九段作战计划。那么，潜艇在这个作战计划中的定位就很明确了，集群作战，针对的美国海军的主力舰队配合水雷战队进行大规模雷击战。所以日本在开战时巨大数量的潜艇，是用来参与舰队决战的。至于破交战？这不重要。
所以日本海军将潜艇编为潜水战队，由一艘潜水战队旗舰指挥（大多是轻巡洋舰，比如5500吨级和阿贺野级），配备一艘潜水母舰进行支援（比如剑崎级）
从上文看出，日本海军潜艇的主要运用思路还是参与大规模的舰队决战，以及一些奇奇怪怪的作战方式，比如伊400型，潜水空母，主要是为了秘密接近美国西海岸和巴拿马运河进行袭击设计的，可以搭载两架专门为潜水空母研制的晴岚水上攻击机。要不就是搭载回天鱼雷进行自杀作战，根本并不是正儿八经的潜艇运用思路。奇葩程度和苏联有一拼。
所以，根据日本海军对于潜艇的运用思路就能看出来了，日本潜艇不会有突出的表现，所取得的战果大多是各种大规模海战中取得的，护航袭击作战取得的战果非常有限。比如大家熟知的伊58号潜艇，出名的原因是击沉了运送原子弹的印第安纳波利斯号重巡洋舰。伊16号潜艇在整个通商破坏作战中击沉4艘运输船，这在日本海军的潜艇中是非常多的了，对于美德的潜艇来说，四艘只是一次出击的斩获。
日本海军潜艇的战果主要集中在军舰上，比如击沉了大黄蜂号的伊19号，同时，大量美国海军水面舰艇也是死于日本潜艇的手上，但是，对于海上交通线的破坏极为有限。虽然日本海军后来也意识到破坏海上交通线是很重要的，但是整个行动的规模一直不大，总的击沉吨位也很低，对于美国造成的影响非常小，或者说根本没有影响。通商破坏作战从1942年就开始了，总的击沉吨位貌似还有没有德国一个王牌艇长击沉的多【摊手。
实际上日本对于敌方的补给线的重视程度一直不足，第一次所罗门海战，三川军一的舰队将美军彻底打残，这时候给瓜岛输送物资的美军运输船已经变成了到嘴边的肥肉，然后三川军一怕损失更多的舰艇，就这么走了，他就这么走了！如果当时三川干掉了这批运输舰，那么瓜岛的美军早饿死，那还有后面激烈的瓜岛争夺战。
畸形的发展思路，导致本该发挥重大作用的潜艇一直到终战时没有发挥任何积极的作用，虽然在开战时日本保有世界上规模最大的潜艇部队，但是其堪称奇葩的运用思路，也为日本海军的失败埋下了祸根。
PS：其实日本潜艇的表现相对于苏联潜艇还是很不错的了，大家可以看看《舰载武器》2008年第12期上的一篇文章，浅谈二战中苏联潜艇使用情况。看完之后你就会发现，苏日潜艇真是一对难兄难弟啊
