1、办学模式不同
单报本：入口是学生，出口主要是技能型应用型高等人才。教学质量控制体系在校内，开放办学程度要求不高，国际化程度较低。
本兼专：入口有学生、科研项目，出口则有学生理论普及，实践较少，对外开放度较高，社会影响力强。
2、职能结构不同
单报本：以教学、实践为主要职能。
本兼专：以教学、科研、成果转化为主要职能。
3、知识结构不同
单报本：横向专业岗位知识模块强调岗位业务知识和实际操作技能，理论以“足够”和“实用”为度。它着眼于“做什么”和“怎么做”，着眼于认识世界范畴的转变，即一个相对完整的实践体系和一个相对不完整的理论体系的统一。
本兼专：纵向框架知识体系强调课程整合、学科整合与整合、跨学科知识转移。关注什么和为什么，关注认识世界的范畴，是相对完整的理论体系和相对不完整的实践体系的统一。
4、师资结构不同
单报本：以硕士学位为主体，教师以教学为主要任务，对教师的评价主要取决于教学效果。”“双师型”教师很受欢迎，更有影响力的学科带头人。
本兼专：硕士学位所占比例较高。教师不仅要教书，还要承担科研任务。教学能力和科研能力是教师评价的主要依据，有影响力的学科带头人更具普遍性。
