你说的这两个保函是不一样的，为便于理解，给你详细解释一下：
履约保函是为了保证中标单位如约履行工程合同的内容
预付款保函是保证在甲方支付了预付款之后能收到合同约定的效果，也即在甲方支付了预付款之后如乙方没有履行合同，银行则将预付款保函的相应押金交还给甲方作为损失补偿。
也就是说这是两个不同的保函，都是要交的。因此从某一个角度也能体现施工单位的经济实力。
不过不用担心，作为预付款的保函既然是为了保证预付款的，就不像履约保函那样一定要到工程全部建设结束，合同内容履行完毕之后才退还给你。
通常是约定保证预付款用在合同上就可以退还了。只是在工程建设前期冻结在银行，后面就解冻了。
扩展资料：
履约保函 Performance Guarantee，履约保函是指：应劳务方和承包方（申请人）的请求，银行金融机构向工程的业主方（受益人）做出的一种履约保证承诺。
如果劳务方和承包方日后未能按时、按质、按量完成其所承建的工程，则银行将向业主方支付一笔约占合约金额5%~10%的款项。履约保函有一定的格式限制，也有一定的条件。
申请条件
1、在申请银行开户；
2、具备履行担保项下合约的能力；
3、项目符合国家规定；
4、提供符合要求的保证金或反担保。
办理程序
·申请人向银行申请开立保函并提供有关资料；
·银行进行调查、审查；
·签定协议，落实保证金或反担保；
·开立履约保函。
适用范围
适用范围非常广泛，可用于任何项目中对当事人履行合同义务提供担保的情况，常见用于工程承包、物资采购等项目。
在工程承包、物资采购等项目中，业主或买方为避免承包方或供货方不履行合同义务而给自身造成损失，通常都要求承包方或供货方缴纳履约保证金，以制约对方行为。履约保函是现金保证金的一种良好的替代形式。
履约保函的优点
对承包方或供货方：
减少由于缴纳现金保证金引起的长时间资金占压，获得资金收益；
与缴纳现金保证金相比，可以使有限的资金得到优化配置；
权益得到更好地维护。
对业主或买方：
合理制约承包人、供货方行为，良好维护自身利益；
避免收取、退回保证金程序的繁琐，提高工作效率。
履约保函（Performance Guarantee）
履约保函：是银行应申请人的要求，向收益人开立的保证申请人履约某项合同项下义务的书面保证文件。
参考资料：百度百科-履约保函
