缺点：
1、五证”不全。商品房之所以公开出售，其主要是具备开发的条件，“五证”齐全，即国有土地使用证、规划许可证、规划工程许可证、施工许可证、商品房预(销)售许可证，而“小产权房”由于缺乏国有土地使用证，也就谈不上规划许可证等“四证”。
2、拆迁无法得到补偿。五十年产权房实际上是属于在政府规定范围以外的违章建筑，如果和国家的规划相冲突，就极有可能被拆除，但是因为其不受法律保护，因此也不会得到拆迁安置补偿。
3、质量难以保证。五十年产权的房屋质量没人监督，通常会在建筑的时候偷工减料，存在安全隐患，而且由于这类房屋一般由土地所在村开发，因此入住后的物业管理也极容易出现问题。
4、不能上市买卖。五十年产权虽然便宜，但是因为不被国家承认，所以不能上市交易，房屋也就不存在增值的可能性，拿来买房的钱一旦遇见房屋毁损的情况，就只能是一去不复返，就连搬家也受到限制。
50年产权住宅与普通住宅项目的不同，主要以下四点：
1、未来使用费用不确定。前者如按公建用途规定，其水、电、暖等使用费用都将采取商用价格。所以，对于购房者应该在购房时询问清楚。目前，开发商大多在前期开发中采取相应的补救措施，能按民用价格缴纳。
2、相关税费的差异。普通住宅项目初次购买和未来转让时契税为1.5%，而50年产权的住宅，其契税按3%缴纳。
3、贷款条件的限制。购买此类房屋大多不能申请公积金贷款，但是也有少数项目在开发商的努力下能够办到。另50年产权或者40年产权的住宅，如采用银行贷款的方式，只能得到五成或六成按揭。
4、建设标准不同。如果按照公建相关要求，前者的人防和消防等建设标准较高，对开发商而言，成本将提高，但对购房者的使用影响不大。
扩展资料：
50年产权住宅，从严格意义上来说，属于房地产开发过程中出现的土地规划用途与开发用途并不完全一致的情况，用40或者50年产权的公建用途土地开发住宅物业只是其中的一种，在房地产市场上，还存在着其他的类似情况，例如工业用途土地开发办公物业等等。
参考资料：
