畜禽和人粪便经过堆沤发酵腐熟后统称为有机肥、农家肥。
有机肥堆沤发酵的主要作用是：
1、通过微生物的作用，将难以被作物利用的有机物变成便于被作物吸收利用的无机养分
2、堆沤中产生的高温可以杀死大部分病菌和虫卵，如果不经堆放直接施用的话，有机肥在土壤里还是有个发酵腐熟的过程，期间产生的热量易发生烧苗现象。而且不经腐熟的有机肥因为含有大量的有机物质，会成为很多害虫的滋生场所，利于害虫在其中越冬。
有机质本来就是要经过发酵腐熟转化以后才能被植物吸收的，粪便堆肥腐熟实际上就是有机质转化过程中产生的不良影响提前到施用之前，加快粪便变为真正有效的肥料的过程。
