曾经辉煌一时，不过后来由于院系改革，被削弱了不少。
1952年，全国高校院系调整，厦门大学被定位为文理科综合性大学：
1、其中工学院航空系并入组建北京航空学院（今北京航空航天大学）；
2、工学院电机、土木、机械系各一部分并入浙江大学，
3、俄语专业并入南京大学。
4、电机、机械系大部并入南京工学院（今东南大学）；
5、土木、建筑系大部并入同济大学；
6、水利专业并入组建华东水利学院（今河海大学）；
7、理学院海洋系中的物理组并入山东大学；
8、航务专科并入组建大连海运学院（今大连海事大学）；
9、 农学院并入组建福建农学院（今福建农林大学）；
10、政法学院（包括政治、法律两系）并入华东政法学院；
11、1953年，商学院企业管理系并入上海财经学院（今上海财经大学）。
12、1954年，文学院教育系并入福建师范教育学院（今福建师范大学）。
13、1957年，参与创建内蒙古大学。
14、1959年，海洋系剩余全部并入组建青岛海洋学院（今中国海洋大学）。
15、1960年，化学系、物理系大批骨干教师，电子物理组技术物理一组、电子物理组及其电子管试制车间，数学系的计算数学、应用数学、 概率论与数理统计专业全部并入组建福州大学。
（至此厦门大学几乎被拆分殆尽，文科和理科后来得到重建恢复，而工科从此一蹶不振）
