一般来说，档案在毕业后择业期可申请两年内由学校代管，择业期内未被转走的档案将在期满后，由学校转到学生户口所在地的人才交流中心；参与西部计划或支教工作的，档案将由学校保管，等支教期满再来学校提档案。
目前国家对于毕业未就业的大学生的档案，一般采取三种方法：
一、把档案转至生源地，由所在地级市的人事局接收。这种方式比较适合准备在生源地范围内就业的毕业生和暂时不想就业的毕业生。
优点：在生源地就业后办理手续简单方便。
缺点：是两年内如离开生源地就业，需重新办理改派手续。
二、把档案留在学校。国家下发文件，允许毕业时尚未落实单位的毕业生户口、档案留校两年。待落实工作单位后，将户籍和档案迁至工作单位所在地。申请档案留校超过两年仍未落实工作的，学校将其档案和户口迁回生源地，学校不再为其发放就业报到证。这种方式适合有就业愿望但尚未就业的毕业生。
优点：学校诚信度较高，代为保管户口关系和档案不收取额外费用。
缺点：毕业生档案留校只是延长了择业期，与学校没有人事隶属关系，涉及人事关系的证明都不能出具。
三、把档案转至就业代理或人才交流中心。这种方式比较适合准备考研、创业、灵活就业的毕业生。
优点：易于毕业生解决一些实际问题。
缺点：由于毕业生与就业指导中心交流相对少，容易造成信息不畅。
“弃档”有三大弊端
毕业生的人事档案记录着学生的个人经历，包括各个时期的学籍卡、成绩单、奖惩证明、党团资料、工作经历等，并且都是原件。
当毕业生参加工作后，会面对如转正定级、职称申报、养老保险办理、人事调动、社保福利、工龄计算、继续深造(如出国、考研)、考公务员等问题，这些方面都离不开档案。因此，高校就业指导中心提醒高校毕业生，档案看似一时用不到，但“弃档”会使个人的一些权益无法得到保障。
首先，会影响个人利益。有了档案，就可以享受到相关的人事、劳动、社会保障服务，如办理社会保险、失业保险等。无论是在原单位供职的人，还是辞职后另谋新职业者，在办理社会保险、领取失业金时，个人档案记录的工龄、工资、待遇、职务、社保参保年限等都是主要依据。
其次，会影响毕业生转正定级和工龄计算。很多大学毕业生找到工作后，没有及时办理参加工作手续，工作几年后仍然是学生身份，从而影响了自己的转正定级。
毕业生想换工作，没有档案，在原单位的工龄就不能计算进来，虽然现在有的单位可以补办新档案，但以前的经历、评价、身份等历史将不复存在，势必会造成一定损失。
第三，会耽误职称评定和工作调转。有的毕业生自大学毕业后，档案既没有提交单位，也没有存在政府指定的人才服务中心，职称评定就会因手续不全而受到影响。
