股指期货的结算可以大致分为两个层次:首先是结算所或交易所的结算部门对会员结算，然后是会员对投资者结算。不管哪个层次，都需要做三件事情：交易处理和头寸管理，就是每天交易后要登记做了哪几笔交易，头寸是多少。财务管理，就是每天要对头寸进行盈亏结算,盈利部分退回保证金，亏损的部分追缴保证金。
风险管理，对结算对象评估风险,计算保证金。其中，财务管理中，需要明确结算的基准价，即所谓的结算价，一般是指期货合约当天临收盘附近一段时间的均价。持仓合约用其持有成本价与结算价比较来计算盈亏，而平仓合约则用平仓价与持有成本 价比较计算盈亏。对于当天开仓的合约，持有成本价等于开仓价，对于当天以前开仓的历史合约,其持有 成本价等于前一天的结算价。
这和股票的成本价计算不同，股指期货的持仓成本价每天都在变。有了结算所，从法律关系上说，股指期货不是在买卖双方之间直接进行，而由结算所成为中央对手方,即成为所有买方的唯一卖方，和所有卖方的唯一买方。结算所以自有资产来担保交易履约。
