长期以来低程度的选育和粗放的饲养管理使土鸡形成了疾病少、耐粗饲的一个特点，再加上土鸡大多数采用的是“四园”（果园、桑园、茶园、竹园）散养，环境远离污染，利于防病。但是因为土鸡的饲养周期较长，加上长期放牧于野外，接触病原体的机会增加，有时还会遇上"四园"作物喷施农药引起土鸡农药中毒，所以散养鸡的防疫不容忽视。除加强日常管理，如严格消毒、隔离饲养以消灭部分疾病外，药物预防不失为一条好途径。 土鸡鸡痘 鸡15～35日龄、90～140日龄时各刺种一次禽痘疫苗，4～5天后刺苗处结痂表明有效，保护率一般在100%。对土鸡的寄生虫病，惟有改善饲养环境，加强营养及饲养工具的消毒才是最有效的预防途径。
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