如何在ubuntu系统下安装gmt4.5软件

2020-05-29 科技 79阅读
下载
官方ftp:ftp://ftp.soest.hawaii.edu/gmt
需要下载的包包括:
gmt-4.5.13-src.tar.bz2
gshhg-gmt-2.3.4.tar.gz
注:GMT中的triangulate命令有两个不同的源码,其中一个遵循GPL协议,另一个不遵循GPL协议。GMT的src包中包含了前者。若有特殊需求,需要使用后者源码的功能,可以下载gmt-4.5.13-non-gpl-src.tar.bz2,并将解压后的triangulate源码覆盖gmt-4.5.13-src.tar.bz2中的相应源码。
依赖关系
基础依赖包
GMT编译过程需要C编译器,以及一些底层的库文件。
对于Ubuntu/Debian:
sudo apt-get install gcc g++ make
sudo apt-get install libxt-dev libxaw7-dev libxmu-dev libSM-dev
对于CentOS/RHEL/Fedora:
sudo yum install gcc gcc-c++ make
sudo yum install libXt-devel libXaw-devel libXmu-devel libSM-devel zlib-devel
软件依赖包
GMT4主要依赖于netCDF4,可以直接使用Linux发行版官方源中提供的netCDF包。除了netcdf之外,建议还安装gdal包。虽然GMT不依赖于gdal,但gdal可以轻松地将其他数据格式转换为GMT可识别的格式。
对于Ubuntu/Debian:
sudo apt-get install libnetcdf-dev libgdal1-dev
对于RHEL/CentOS/Fedora:
sudo yum install netcdf netcdf-devel gdal gdal-devel
注意:
一定不要试图自己手动编译netCDF。如果在阅读本文之前曾经手动编译过,一定要将原来手动编译生成的文件删除干净。通常可以使用locate netcdf,找到/usr/local目录下的与netCDF相关的文件,直接删除即可。
CentOS和RHEL的官方源中没有netCDF,需要首先添加EPEL源再安装netCDF;Fedora官方源中自带netCDF;
安装GMT
编译GMT源码
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$ tar -jxvf gmt-4.5.13-src.tar.bz2
$ cd gmt-4.5.13
$ ./configure --prefix=/opt/GMT-4.5.13
$ make
$ sudo make install-all
其中--prefix指定了GMT安装路径,你可以指定为其他路径,但要注意后面其他步骤要与这里的路径统一。
安装海岸线数据
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$ tar -zxvf gshhg-gmt-2.3.4.tar.gz
$ sudo mkdir /opt/GMT-4.5.13/share/coast
$ sudo cp -r gshhg-gmt-2.3.4/* /opt/GMT-4.5.13/share/coast/
修改环境变量
向~/.bashrc中加入GMT4的环境变量,并使环境变量生效:
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$ echo 'export GMT4HOME=/opt/GMT-4.5.13' >> ~/.bashrc
$ echo 'export PATH=${GMT4HOME}/bin:$PATH' >> ~/.bashrc
$ echo 'export LD_LIBRARY_PATH=${LD_LIBRARY_PATH}:${GMT4HOME}/lib64' >> ~/.bashrc
$ exec $SHELL -l
说明:
第一个命令向~/.bashrc中添加环境变量GMT4HOME;
第二个命令修改~/.bashrc,将GMT4的bin目录加入到PATH中;
第三个命令将GMT4的lib目录加入到动态链接库路径中,若为32位系统,则为lib;64位系统则为lib64;
第四个命令是重新载入bash,相当于source ~/.bashrc。
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