中国科学院上海天文台从1964年开始招收培养研究生，文化大革命期间中断，1978年起恢复招收研究生。经国务院学位委员会批准，上海天文台成为天文学一级学科博士和硕士学位授权点。1978年首批被批准为“天体测量与天体力学”专业博士学位授权点后，1986年，“天文仪器与方法”专业被批准为硕士学位授权点。1989年，中国科学院同意天文台开展在职人员申请学位试点工作。1990年，“天体物理”专业自行审批通过为硕士学位授权点。1991年，被国务院学位委员会批准可授予具有研究生毕业同等学力的在职人员硕士、博士学位试点单位。1998年，在全国天文界内又首批获准可按“天文学”一级学科授予博士学位，2011年新增“仪器仪表工程”全日制专业学位工程硕士培养点，这也是上海天文台首次获得全日制专业学位工程硕士培养点。
博士后流动站：天文学
博士授予点：天体测量与天体力学、天文学
硕士授予点：天文学 、天文仪器与方法、天体物理
专业学位工程硕士培养点：仪器仪表工程 2014年4月，中国科学院上海天文台有在读硕士生60多人，博士生60多人，在读留学生4名，联合培养学生50多名。
根据2015年12月天文台官网显示，在站外籍及港澳台博士后11人，占在站人数的50%。
