可以合并计算工作年限。
根据《劳动合同法实施条例》第十条 劳动者非因本人原因从原用人单位被安排到新用人单位工作的，劳动者在原用人单位的工作年限合并计算为新用人单位的工作年限。原用人单位已经向劳动者支付经济补偿的，新用人单位在依法解除、终止劳动合同计算支付经济补偿的工作年限时，不再计算劳动者在原用人单位的工作年限。
你在B子公司的工龄应该包括A子公司的工龄（如果有工龄工资之类的话）。如果A子公司在你离职的时候没有给予补偿金，可以在B子公司离职时候合并计算。
未避免你今后的损失，建议你保留公司要求你从A公司调B公司的书面通知。如果没有，可以要求公司给予一个证明你，或者签订一个三方协议。
