科学城一中由中国工程物理研究院将谨灶原院属九所具有近30年办学历史的子弟中学进行调整、优化、集中，于1990年重组而成的一所大型高完中。
1992年、1994年先后被省教委授予“四川省企事业办学先进学校”、“德育工作先进学校”等荣誉称号。
1994年、1996年分获“四川省体育传统项目学校先进集体”称号；
1995年被授予“全国知名中学科研联合体成员学校”、“四川省环境教育先进集体”称号；
1996年晋升为四川省重点中学；
1997年被授予四川省“校风示范校”称号；
1998年成为“全国知名中学庆晌指科研联合体成员学校”；
1999年通过了四川省“国家级示范性高中”的检查验收；
2000年被授予“国家基础教育重点科研课题基地学校”称号；
2001年被授予“四川省现代教育技术示范学校”；
2002年被授予“四川省心理健康教育示范学校”；
2002年被授予“四川省青少年科技教育示范学校”；
2004年通过了“四川省实验教学示范学校”；
2005年被授予四川省第二批“绿化示范学校”；
2006年获“四川省青少年智能誉配机器人活动实验学校”；
2005—2011年连续七年蝉联“绵阳市高考质量综合评估一等奖”。
2014年被评为“四川省一级示范高中”。
