不是同一个车站。主要区别是，车站地址不同、车站规模不同、车站历史不同，具体如下：
一、车站地址不同
1、惠州汽车总站
车站地址：广东省惠州市惠城区龙丰街道鹅岭南路71号。
2、惠阳汽车客运总站
车站地址：惠阳淡水桥背永兴路。
二、车站规模不同
1、惠州汽车总站
截至2018年10月，惠州市汽车客运站建筑总面积9.1720万平方米。候车室设计同时容纳旅客数量5000人，车站内设50个大巴发车位、250个大巴停放车位和1272个地下停车位，设计年度平均日发送旅客量近期2.5万人次、日发送客车2923班次。
2、惠阳汽车客运总站
占地面积5.1万平方米，站前广场有5910平方米，日发送旅客能力为5000～9000人次，发车位20个，接驳公交车500班次。
三、车站历史不同
1、惠州汽车总站
惠州市汽车客运站始建于民国10年（1921年），于1963年7月1日移至惠州镇新建路77号，于1966年搬至惠州市佛祖坳， 于2018年10月21日迁至惠城区天平山，改名为惠州市汽车客运南站。2019年2月27日，惠州市汽车客运南站更名回惠州市汽车客运站。
2、惠阳汽车客运总站
惠阳汽车客运总站于2007年11月底动工兴建，于2010年1月8日正式竣工。
参考资料来源：百度百科-惠州汽车总站
参考资料来源：百度百科-惠阳汽车客运总站
